Nadležno ministarstvo za veterinu može povjeriti pojedine poslove službenih kontrola hrane životinjskog podrijetla , hrane za životinje, nusproizvoda i od njih dobivenih proizvoda ovlaštenim veterinarskim organizacijama kao kontrolnim tijelima u skladu s Uredbom (EZ) br. 882/2004. S kontrolnim tijelom se zaključuje ugovor o povjeravanju poslova na vrijeme od 5 godina. Nadležno ministarstvo provodi inspekcijski nadzor, odnosno organizira reviziju rada kontrolnih tijela i izvješćuje Europsku komisiju o povjeravanju poslova službenih kontrola kontrolnim tijelima u skladu s člankom 5. Uredbe (EZ) br. 882/2004.
Nadležno ministarstvo može prenijeti specifične zadaće kontrolnom tijelu, ako postoji dokaz da kontrolno tijelo ispunjava sljedeće uvjete:
1. raspolaže stručnošću, opremom i infrastrukturom neophodnom zaobavljanje zadaća koje su mu prenesene,
2. raspolaže dovoljnim brojem odgovarajuće kvalificiranog i iskusnog osoblja,
3. nepristrano je i ne postoji sukob interesa u odnosu na obavljanje zadaća koje su mu prenesene.
Ovlašteno kontrolno tijelo se mora akreditirati prema normi HRN EN ISO/IEC 17020. Mora biti nepristrano i ne smije biti u sukobu interesa u svezi s povjerenim poslovima, kontrolno tijelo mora raspolagati dovoljnim brojem odgovarajućeg kvalificiranog i iskusnog osoblja koje nije u sukobu interesa u obavljanju službenih kontrola, kontrolno tijelo mora raspolagati stručnošću, opremom i infrastrukturom neophodnom za obavljanje poslova. Kontrolno tijelo obavještava nadležno ministarstvo o rezultatima provedenih kontrola redovito i kad god to nadležno ministarstvo zatraži.
Poslovi koji se povjeravaju kontrolnim tijelima:
1. Zadaci u poslovima revizije i kontrole dobre proizvođačke prakse i dobre higijenske prakse te postupaka vezanih uz primjenu načela koja se temelje na sustavu analize opasnosti i kritičnih kontrolnih točaka.
2. Zadaci u inspekcijskim poslovima:
-prikupljanje podataka o prehrambenom lancu;
-ante mortem pregled;
-kontrola postupanja u skladu s propisima o dobrobiti;
-post mortem pregled;
-kontrola postupanja sa specifičnim rizičnim materijalima i ostalim nusproizvodima životinjskog podrijetla koji nisu za prehranu ljudi.
3. Uzorkovanje za laboratorijsko ispitivanje.
4. Uzorkovanje u svrhu monitoringa.
5. Kontrola sukladnosti koje se odnose na primjenu identifikacijskih oznaka, kao i provjere sukladnosti s ostalim zahtjevima sljedivosti.
Više podataka o veterinarskim kontrolnim tijelima saznajte u novom Zakonu o veterinarstvu (NN 82/13).